利用SCoT检测菜心F2分离群体的遗传多样性

Southwest China Journal of Agricultural Sciences(2018)

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摘要
[目的]以菜心抗小菜蛾品种Caixin65和感小菜蛾品种Caxixin69及其杂交后代所得的54份F2∶3家系为实验材料,利用SCoT标记检测亲本及子代分离群体的遗传多样性,为新品种选育和分子标记辅助育种提供基础材料和理论基础.[方法]利用筛选的17条SCoT引物检测54份菜心F2∶3家系及2个亲本的遗传多样性.[结果]17对引物共扩增出条带161条,其中多态性条带共61条,多态性条带百分率为38.80%;平均每条引物扩增出条带9条,其中多态性条带4条.平均多态性位点百分率为45.02%,平均观察等位基因数(Na)为1.1613;平均有效等位基因数为1.3184;平均Shannon多样性指数(I)为0.2723;平均期望杂合度(He)为0.1865;平均Nei遗传距离为0.225.表明多数家系的分子遗传距离相近,F2∶3家系的遗传多样性较低,但少数家系之间已经发生了遗传多样性变化.在Nie遗传距离0.080之处,可以将56份菜心分为5类.SCoT标记没有检测出多数家系间的显著的基因组变化,少数家系呈现出ScoT多态性,表明SCoT标记可以继续用于优异家系选育.[结论]SCoT标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,通过SCoT检测表明大部分菜心F2∶3家系间遗传距离接近,但少数家系间已经发生了分离,将SCoT标记用于菜心F2分离群体的遗传多样性检测,结合表型筛选将有助于品种选育效率的提高.
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