巨(鲜)线粒体DNA ND6基因克隆及多态性分析
Jiangsu Agricultural Sciences(2016)
摘要
利用GenBank数据库中(垗)科鱼线粒体ND6基因序列保守区设计引物,采用PCR技术克隆并测序,共得到12尾巨(鲜)ND6基因全序列.用DNAMAN 5.0软件比对序列,MEGA 5.0软件分析(鲜)科不同鱼类的进化关系,结果表明:巨(鲜)ND6基因序列全长为516 bp,碱基含量分别为14.20%、34.50%、40.20%、11.00%,其中"A+T"含量(54.40%)高于"G+C"含量(45.50%),存在4个单倍型,发生3次颠换;12个个体4个单倍型间的平均相对遗传距离为0.003;将巨(鲜)与其他14种鱼类的ND6基因用Neighbore-Joining(NJ)法构建系统发育树,发现巨(鲜)单独聚为1支.研究将为今后鱼类线粒体基因组的研究提供科学依据.
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