水滴伪康纤虫全长cDNA文库的构建及EST分析

水滴伪康纤虫为海水养殖鱼类的重要危害性寄生虫.采用SMART技术构建营养期水滴伪康纤虫全长cDNA文库,初始文库滴度3.3×106 pfu·mL-1,文库容量约为1.5×107 pfu,重组率97％.随机挑取24个克隆,经PCR检测插入的片段长度在0.3～2.0 kb,平均长度＞500 bp.挑选文库中的1 200个克隆进行表达序列标签测序,得到1 032条高质量的EST,与NCB2数据库进行比对后,获得292个同源基因,其中包含190条单拷贝EST和102个重叠群,冗余度为71.7％.有215条EST在Tetrah ymena thermophila,Paramecium tetraurelia,Ichth yophthirius multifiliis,Cryptocaryon irritans,Ox ytricha trifallax等自由生活及寄生种类的纤毛虫的基因组中比对到同源基因,其中有134条EST具有功能注释,其余为未知功能的假定蛋白基因.水滴伪康纤虫cDNA文库的构建及EST测序的完成,为进一步发现和研究水滴伪康纤虫的功能基因奠定了基础.