沙棘CAT家族基因的生物信息学分析
Tianjin Agricultural Sciences（2019）
摘要
CAT (Cationic amino acid transporters)是植物体内参与氨基酸的吸收与转运的一类跨膜转运蛋白.为探究CAT家族基因及其所编码蛋白的结构特征,本研究依据前期所获得的不同发育期沙棘果实的转录组测序数据,经过功能注释与分析后获得3个CAT家族成员基因,分别命名为HrCATI、HrCAT2和HrCAT3,并对其进行生物信息学分析.结果 表明,沙棘果实HrCAT家族基因均含有完整的开放阅读框,编码二级结构以α-螺旋为主、不含信号肽的非分泌蛋白,其中HrCAT1和HrCAT2蛋白的三级结构之间具有较高相似性.研究结果可为后续研究沙棘果肉HrCAT基因的表达调控提供理论依据.
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