一株新城疫病毒F基因的克隆及其遗传进化分析

从新乡市某养鸡场的疑似新城疫病鸡群中分离到1株新城疫病毒,并对该病毒分离株进行F基因的扩增、序列测定和遗传进化分析.结果表明,该新城疫病毒分离株的F基因全长为1662 bp,F蛋白裂解位点区的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,具备强毒株的特征;同源性分析表明,该新城疫病毒分离株与国内外流行的基因Ⅶ型强毒株之间的同源性较高,为87.5％～97.7％,其中与国内流行的基因Ⅶd型的参考毒株同源性最高,为95.4％～97.7％,而与现用疫苗株La Sota、Clone-30、B1、Mukteswar等同源性较低,84.2％～86.6％;系统进化树分析表明,该新城疫病毒分离株与基因Ⅶd型参考毒株FJ882014、FJ608335和GU227738处在同一个进化分支上,亲缘关系最近.