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9种真菌中分支点结合蛋白的生物信息学分析

Inner Mongolia Agricultural Science and Technology(2020)

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Abstract
[目的]进一步了解分支点结合蛋白(branchpoint-bridging protein,BBP)在真菌中的生物学功能.[方法]利用多种生物信息学软件和网站对9种真菌[稻瘟病菌(Pyricularia oryzae)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、小麦全蚀病菌(Gaeumannomyces tritici)、粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)、西瓜炭疽病菌(Colletotrichum orbiculare)、白僵菌(Beauveria bassiana)、尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)、水稻恶苗病菌(Fusarium fujikuroi)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)]的BBP进行预测分析,包括蛋白与基因的基本信息、理化性质、亚细胞定位、信号肽与跨膜螺旋结构、蛋白质空间构象及磷酸化位点与SUMO化位点,并构建系统进化树.[结果]BBP的分子量在50812.65~68306.99 Da,均为碱性不稳定的亲水性蛋白,存在于细胞核中,无信号肽及跨膜螺旋,磷酸化位点及占比相似,α螺旋是主要的二级结构,均具有SF1-HH、KH_dom和Znf_CCHC结构域,然而酿酒酵母ONH80283.1和立枯丝核菌CCO28600.1与其他真菌BBP相比在分子进化和空间构象上有较明显差异,且CCO28600.1的SUMO化位点较多.[结论]9种常见真菌中,酿酒酵母和立枯丝核菌的BBP结构比较特殊,BBP在稻瘟病菌、小麦全蚀病菌、粗糙脉孢菌、西瓜炭疽病菌、白僵菌、尖孢镰刀菌、水稻恶苗病菌中进化比较保守.
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