小鼠胚胎胃肠道和胎盘组织的菌群构成研究

目的 探讨小鼠胚胎胃肠道和胎盘组织的菌群构成.方法 采集昆明系孕鼠的胚胎组织和胎盘组织24份,分别为孕早期(孕12～ 13 d)胚胎胃肠道组织、孕晚期(孕19 ～20 d)胚胎胃肠道组织和孕晚期(孕19 ～20 d)胎盘组织各8份.应用血液或组织DNA提取试剂盒提取胃肠道组织和胎盘组织菌群的DNA,然后将24个样本所提取的DNA进行高通量测序.统计学方法采用方差分析.结果 孕鼠胚胎胃肠道组织及胎盘组织的菌群在“门”水平有4个优势菌群,分别是变形菌门(95.00％、88.14％、87.26％),拟杆菌门(1.71％、2.15％、2.63％),放线菌门(1.16％、4.10％、3.38％)及厚壁菌门(0.75％、2.62％、2.01％).在科水平有9个优势菌科,其中以肠杆菌科(46.99％、44.34％、41.08％)、希瓦菌科(21.99％、21.10％、19.05％)、莫拉菌科(9.18％、7.09％、5.64％)为主.菌群种类孕早期和孕晚期胚胎胃肠道菌群分别为65.44％和62.73％,与孕晚期胎盘组织菌群相同.菌群丰度“科”水平3组相同菌群的含量分别占78.16％、72.53％及65.78％.结论 胚胎胃肠道和胎盘组织有菌群定植,同时对其进行了分类.