基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析广西无盐发酵酸笋中细菌多样性
China Brewing(2019)
摘要
以10年老酸水泡制酸笋样品(B SFA F)、发酵6个月块状酸笋(M B SF)和丝状酸笋样品(FB SF)为研究对象,应用Illum ina M iSeq高通量测序技术并通过生物信息统计与分析,探索广西无盐发酵酸笋样品中细菌菌群结构及多样性.结果表明:3组酸笋样品共得到148656个有效的序列数(Tags),聚类后总共得到1116个分类操作单元(O TU s).根据物种注释结果,在3组酸笋样品中共注释到12个门、23个纲、37个目、98个科和190个属.在门分类水平上,3组样品中厚壁菌门(Firm icutes)占绝对优势,其次是变形杆菌门(Proteobacteria)和放线菌门(A ctinobacteria);在属分类水平上,乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)和魏斯氏菌属(W eis-sella)是3组样品中的优势菌属.其中,丝状酸笋(FB SF)组的香农(Shannon)、辛普森(Sim pson)及A C E指数均显著高于其他两组,且乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)和魏斯氏菌属(W eissella)的平均相对丰度总和最高,可达99.8%.因此,以泉水泡制发酵丝状竹笋生产酸笋可能更佳.
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