12种真菌钾离子通道蛋白生物信息学分析

利用生物信息学对真菌钾离子通道蛋白进行序列分析,推断并预测其结构和功能.本文筛选了酿酒酵母、黄曲霉、烟曲霉、禾谷镰刀菌、玉米黑粉菌、布拉克须霉等12种真菌的钾离子通道蛋白,综合采用Blast、ProtParam、SignalP和Swiss-Model等生物信息学网站和软件对这些蛋白的理化性质、系统进化、蛋白结构和功能域等进行了分析.结果表明:所选择的钾离子通道蛋白氨基酸序列长度在659～928 aa之间,理论等电点在5.45～9.54之间,主要定位在质膜、液泡上.二级结构分析表明,真菌钾离子通道蛋白均由α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成,其空间结构高度相似,且12种钾离子通道蛋白都拥有保守的TxGYGD钾离子选择器特征片段.