双孢蘑菇胞外分泌蛋白质组的功能预测及分析

以双孢蘑菇(Agaricus bisporus)10448个蛋白为研究对象,综合利用信号肽分析软件SignalP 4.1、跨膜结构预测软件TMHMM v2.0、GPI锚定位点预测软件big-Pi Predictor以及亚细胞蛋白定位软件TargetP1.1等生物信息学软件,筛选双孢蘑菇胞外分泌蛋白质序列,使用分析软件BLAST2GO进行功能注释.筛选得到469个胞外分泌蛋白质序列,统计发现编码这些蛋白质的开放阅读框(open reading frame,ORF)最长为4800 bp,平均为1233 bp.除去假定蛋白质,双孢蘑菇胞外分泌蛋白质的生物代谢途径主要有生物大分子代谢(22.2％)、碳水化合物代谢(17.4％)、脂质代谢(3.2％)、芳香化合物代谢(2.2％)等.同时,共发现133种酶类,其中包括糖苷水解酶(38.5％)、多铜氧化酶(7.4％)、肽酶(7.0％)、果胶裂解酶(4.0％)和羧酸酯酶(2.9％)等.