桃同株叶片杂色材料的MSAP分析

wf(2016)

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Abstract
为探寻桃同株叶片杂色材料PCM?1的突变机制,建立了桃PCM?1G和PCM?1R DNA样品的基因池,用256对甲基化敏感扩增多态性( MSAP )选择性扩增引物进行全基因组甲基化MSAP分析。筛选出23对条带清晰、丰富且重复性好的引物组合。扩增出200~1000 bp的位点397个,其中PCM?1G、PCM?1R两种类型半甲基化位点分别为38个和44个,分别占全部位点的9?6%和11?1%;全甲基化位点分别为64个和67个,分别占全部位点的16?1%和16?9%;总甲基化率分别为25?7%和28?0%。成功分离了29条甲基化修饰DNA序列,通过测序发现有22条能够得到桃基因组支持且同源性较高,其中2条来自于类胡萝卜素裂解双加氧酶4( CCD4)、3条来自于Omega?羟基棕榈酸阿魏酸转移酶;推测CCD4和Omega?羟基棕榈酸阿魏酸转移酶可能与叶色嵌合突变有关。
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