非洲猪瘟病毒p72蛋白抗原表位预测分析及多表位疫苗的构建

Chinese Journal of Veterinary Medicine(2020)

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Abstract
为了预测非洲猪瘟病毒2018/AnhuiXCGQ株p72蛋白的T、B淋巴细胞抗原表位,并完成多表位疫苗的构建.试验采用生物信息学技术ExPASy、SOMPA、PSIPRED Server、DNASTAR及Phyre对该蛋白的理化性质、二级结构、三级结构进行初步预测分析,运用ABCpred Prediction、Scratch、NetCTL及IEDB预测其T、B淋巴细胞表位,最终设计构建得到多表位疫苗.依据各生物学方法分析预测,得到B淋巴细胞优势表位:110~ 120、77~ 88、45~ 55、12~18、27~ 37位置;T淋巴细胞优势表位298 ~307、520 ~531、203 ~212位置,并设计得到T、B淋巴细胞表位表达盒,ExPASy预测表示该表位盒为亲水性蛋白.以此多表位表达盒为目的基因,以pET-28a构建设计多表位疫苗.表明该蛋白有多个潜在抗原表位,并可依据预测得到的蛋白二级结构、三级结构等参数信息及多个预测抗原位点构建ASFV多表位疫苗,表达纯化用于免疫试验.
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