利用GEO数据库分析结肠癌中EZH2及其相关基因的表达与意义

user-5f8cf9244c775ec6fa691c99(2016)

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Abstract
目的:探讨果蝇Zeste基因增强子人类同源物(EZH2)在结肠癌的表达情况、评估对结直肠癌患者预后的意义,并分析预测与其相关的基因及细胞通路。方法通过GEO数据库下载基因芯片GSE17538数据内包含232例结直肠癌病例;结合R2平台,筛选出与EZH2表达显著相关的基因并进行GO和KEGG通路分析;通过Kaplan-Meier法绘制生存曲线,研究EZH2与患者预后、生存之间的关系。结果232例结肠癌标本中,EZH2的表达与年龄(χ2=4.426,P=0.035)、AJCC分期(χ2=8.259,P=0.041)和分化程度(χ2=7.301,P=0.026)有关,与性别(χ2=0.622,P=0.430)无关。全部检测出与EZH2表达显著相关基因共4305个(其中正相关2240个、负相关2065个),对GO及KEGG通路分析后发现其中1509个相关基因涉及细胞周期、RNA的转录、DNA复制等多个肿瘤发生、发展过程。Kaplan-Meier法分析,EZH2的表达与患者的无病生存期有相关性(P<0.05)。结论推测EZH2可成为研究患者预后的分子标志物,为未来深入研究提供参考。
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KEGG,Gene expression,Gene,Colorectal cancer,Microarray,Transcription (biology),EZH2,Computational biology,DNA replication,Biology
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