基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析

Journal of Anhui Agricultural University(2018)

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Abstract
通过探究淮南麻黄鸡的遗传多样性和遗传结构,为淮南麻黄鸡的种质资源保护和开发利用提供遗传背景资料.对淮南麻黄鸡线粒体基因组(mitochondrial genome,mtDNA)控制区全序列进行测序,并结合红色原鸡的序列进行生物信息学分析.淮南麻黄鸡mtDNA控制区全长1 231~1 232 bp,共发现26处单核苷酸变异位点,核苷酸多样性(Pi)为0.006 6,单倍型多样性(Hd)为0.917,平均核苷酸差异(K)为7.573.群体共包含14种单倍型,可以分为A、B、C和E4个分支分别包括3、3、7和1种单倍型.淮南麻黄鸡在线粒体水平上有较高的多态性,并且来自多个不同的母系,有很好的开发潜力.
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Key words
yellow partridge chickens,mitochondrial dna marker,genetic diversity,huainan
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