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不同鸡种mtDNA D-loop区的遗传多样性研究

China Poultry(2018)

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Abstract
为更好地保护和利用太行鸡、坝上长尾鸡和北京油鸡遗传资源,阐明其遗传多样性及分化关系,采用PCR产物直接测序法,测定了3个鸡种的138个个体mtDNA D-loop全序列.结果显示:在所测定的mtDNA D-loop序列中,共检测到70个变异位点(包括31个单一位点突变和39个简约信息位点),组成49种单倍型.群体内序列间核苷酸平均差异数为9.179,核苷酸多样性为0.0075±0.0002,平均单倍型多样性为0.960±0.006.太行鸡、坝上长尾鸡和北京油鸡的单倍型数分别为24、21和14个,均有品种特异的单倍型.邻接树显示3个鸡种与红原鸡聚为一簇,与灰原鸡分开.Network结构图显示,3个鸡群体可划分到A、B、C、E和Y共5个世系分支中.结果表明,3个地方鸡遗传多样性丰富,群体间存在明显遗传分化;太行鸡和坝上长尾鸡在一定程度上受到商品鸡血统的影响.
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Key words
different local chicken breeds,mitochondrial dna,genetic diversity,gallus domesticus,d-loop
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