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男性不育患者精液来源的金黄色葡萄球菌精子制动相关基因研究

Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology(2020)

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Abstract
目的:分析分离自男性不育症患者精液的精子制动阳性金黄色葡萄球菌的全基因组信息,发掘可能编码导致精子制动的蛋白和基因. 方法:收集分离男性不育症患者精液中的金黄色葡萄球菌(共22株),并根据其对精子的制动能力分为精子制动阳性组与制动阴性组,随后选出各组最具有代表性的菌株M J015(制动阳性株)与M J163(制动阴性株),分别提取其DNA进行全基因组测序,对获得的测序结果进行全基因组序列拼接并提交NCBI进行注释,MJ015的NCBI登录号为CP038183,MJ163的NCBI登录号为CP038229,同时使用BRIG软件进行BLAST比对并制作圈图,使用Artemis软件套装对MJ015与MJ163进行详细比对以寻找目标基因. 结果:M J015的染色体全基因组序列总长为2 784 836 bp,含有2个质粒,MJ163的染色体全基因组序列总长为2 746 673 bp,包括1个质粒,MJ015和MJ163的GC含量分别为32.13%、32.08%,MJ015和MJ163分别注释有2 921个和2 844个基因,且经过比对发现M J015与MJ163的全基因组序列有约130 kb的序列未能比对上,在这些差异序列中所包含的SAK基因,其表达产物经实验证实为这两株菌表达的差异蛋白. 结论:经序列分析与实验验证,金黄色葡萄球菌M J015基因组上的SAK基因可能是使精子制动的关键基因,其表达的产物葡激酶对精子制动的能力强弱的影响有待进一步研究证实.
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Key words
comparative genomics , male infertility, whole genome sequence,Staphylococcus aureus
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