卫生部微生物室间质评1012菌的鉴定与放线菌属的系统发生分析

目的 对卫生部临床检验中心2010年微生物室间质评1012菌进行鉴定，研究1012菌的分类学位置及放线菌属的系统分类现状。方法采用传统的细菌学形态检查、商品化的API、以及16S rRNA基因测序等多种手段对1012菌进行系统的鉴定。结合远程计算机系统提供的原核生物信息，构建放线菌属及相关细菌的16S rRNA基因的系统发生树，研究放线菌属的系统进化及1012菌与相关菌种之间的亲缘关系。结果1012菌为兼性厌氧、不形成芽胞的革兰氏阳性棒状菌，60多项生化实验，除L-阿拉伯糖发酵实验阴性，其余与图列茨放线菌一致。16S rRNA基因序列分析结果显示：1012菌与图列茨放线菌的同源性高达99.8％，但与放线菌属的模式菌种——牛放线菌的同源性仅为90.6％。进一步的系统发生树亦表明，放线菌科的五个菌属清晰地聚类成9个“基因属”，小弯杆菌、动弯杆菌、放线杆菌、隐秘杆菌4个菌属分别包含单一的基因群，而放线菌属则包含了5个独立的基因群。结论1012菌可鉴定为图列放线菌，但从基因的角度上分析，当前的放线菌属的组成结构过于松散，可能会重新分类。