人巨细胞病毒无症状性感染者UL146基因特征分析
Chinese journal of microbiology and immunology(2017)
Abstract
目的 研究人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)UL146基因序列在无症状性感染者中的多态性.方法 采集47例HCMV DNA阳性无症状感染者尿标本,采用聚合酶链反应(PCR)扩增UL146基因全序列,阳性扩增产物测序后,运用生物信息学软件进行序列特征分析.结果 47例无症状HCMV感染者尿沉渣标本中,17例标本UL146基因扩增阳性.序列分析显示:无症状HCMV感染者UL146基因核苷酸变异率为0~42.5%,氨基酸变异率为0~67.7%,突变遍布整个基因;与Towne株相比,其信号肽序列(signal sequence)及羧基末端(C-terminal)变异较大;种系进化树分析显示,17例无症状HCMV感染者UL146基因分布在G1、G8、G9和G11四个型别中,未见其他基因型.分析翻译后修饰位点显示,四个型别修饰方式差异较大,但其重要功能区ELRCXC趋化因子区呈现高度保守性.二级结构预测提示,其活性蛋白均以无规卷曲居多,四个型别等电点和分子量大小不尽相同.结论 HCMV无症状性感染者UL146基因在核苷酸序列和氨基酸结构层面均高度变异,但重要功能区高度保守,其基因型于无症状性感染者中的分布,与既往显性感染的研究结果不存在明显差异,但以G1、G8、G9、G11四个型别为主.
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Key words
Human cytomegalovirus,Asymptomatic infection,UL146,Polymorphism
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