基于蛋白质区块结构码技术对EV71病毒抑制剂的高通量筛选

目的 运用蛋白质区块结构码技术对EV71病毒抑制剂进行筛选.方法 从-PDB数据库中提取EV71病毒的复合物晶体结构.通过使用蛋白质区块结构码技术和Discovery Studio Visualizer软件对PDB数据库中含有12种不同小分子化合物的EV71蛋白晶体结构的靶点区进行分析.分别采用不同EV71病毒蛋白的三类靶点片段所在的蛋白A链扫描晶体结构一维码数据库以期发现和EV71病毒蛋白靶点结构相似的新的靶蛋白.靶点结构相似的靶蛋白所作用的小分子可能成为EV71病毒的抑制剂.结果 POLG蛋白和EV71病毒蛋白靶点结构相似,两种POLG蛋白的抑制剂CHEMBL216000,CHEMBL222234可能成为EV71病毒的抑制剂.结论 从药物靶点结构角度阐述了小分子化合物和EV71病毒蛋白的作用机理.通过靶点结构序列的比对挖掘新的靶蛋白,进而为EV71病毒抑制剂的开发提供有益的线索.