长链非编码RNA人肺腺癌转移相关转录本1在早产儿高氧肺损伤中的表达及意义

Chinese Pediatric Emergency Medicine(2017)

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摘要
目的 探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)人肺腺癌转移相关转录本1 (metastasis associated in lung denocarcinoma transcript 1,MALAT1)对早产儿高氧肺损伤的保护作用.方法 从基因表达数据库GEO(gene expression omnibus)下载芯片数据集GSE25286(Affymetrix Mouse Genome 4302.0 Array),依据高氧暴露与否,比较14 d、29 d的小鼠正常肺组织和高氧肺损伤的肺组织MALAT1 mRNA的表达.从GEO中下载芯片数据集GSE43830(Human Exon 1.0 ST Arrays),在WI 38细胞(肺成纤维细胞)中敲除MALAT1后和未敲除MALAT1的WI38细胞中,用反义RNA技术检测比较多种基因如细胞分裂周期蛋白6(cell division cycle 6,CDC6)、死亡效应结构域蛋白2(death effector domain containing 2,DEDD2)及细胞周期蛋白Cyclin B1(CCNB1)的表达变化.同时,收集早产儿外周血标本验证,2015年1月至2016年12月在我院NICU住院治疗的高氧肺损伤早产儿20例为试验组,无高氧肺损伤的20例早产儿为对照组,采集40例早产儿末梢外周血,抽提RNA,逆转录后进行Real time-PCR检测40例早产儿外周血MALAT1的表达,收集并分析40例早产儿的一般临床资料.结果(1)通过使用软件对芯片源文件进行预处理和差异表达基因筛选,从最终的差异表达基因中发现, lncRNA MALAT1在高氧肺损伤的小鼠肺组织中表达明显上调[差异倍数(fold change,FC) =2.33,P=0.001].(2)WI38细胞 MALAT1敲除后,MALAT1表达大幅下调(FC = -15.6,P =0.000),CDC6 (FC= -2.37,P =0.001)及 CCNB1(FC = -2.16,P =0.002)均表达下调,DEDD2表达上调(FC =2.46,P=0.000).(3)早产儿外周血标本验证结果表明,与对照组早产儿(0.2734 ± 0.0673)比较, MALAT1在高氧肺损伤早产儿的外周血中表达显著上调(0.3755 ± 0.0819,t =4.634,P =0.015).结论 lncRNA MALAT1可能通过抑制细胞凋亡,对早产儿高氧肺损伤起保护作用,为临床防治早产儿高氧肺损伤提供新策略.
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关键词
Long noncoding RNA,Neonates,Lung injury,Metastasis associated in lung denocar-cinoma transcript 1,Hyperoxia
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