长链非编码RNA人肺腺癌转移相关转录本1在早产儿高氧肺损伤中的表达及意义
Chinese Pediatric Emergency Medicine(2017)
摘要
目的 探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)人肺腺癌转移相关转录本1 (metastasis associated in lung denocarcinoma transcript 1,MALAT1)对早产儿高氧肺损伤的保护作用.方法 从基因表达数据库GEO(gene expression omnibus)下载芯片数据集GSE25286(Affymetrix Mouse Genome 4302.0 Array),依据高氧暴露与否,比较14 d、29 d的小鼠正常肺组织和高氧肺损伤的肺组织MALAT1 mRNA的表达.从GEO中下载芯片数据集GSE43830(Human Exon 1.0 ST Arrays),在WI 38细胞(肺成纤维细胞)中敲除MALAT1后和未敲除MALAT1的WI38细胞中,用反义RNA技术检测比较多种基因如细胞分裂周期蛋白6(cell division cycle 6,CDC6)、死亡效应结构域蛋白2(death effector domain containing 2,DEDD2)及细胞周期蛋白Cyclin B1(CCNB1)的表达变化.同时,收集早产儿外周血标本验证,2015年1月至2016年12月在我院NICU住院治疗的高氧肺损伤早产儿20例为试验组,无高氧肺损伤的20例早产儿为对照组,采集40例早产儿末梢外周血,抽提RNA,逆转录后进行Real time-PCR检测40例早产儿外周血MALAT1的表达,收集并分析40例早产儿的一般临床资料.结果(1)通过使用软件对芯片源文件进行预处理和差异表达基因筛选,从最终的差异表达基因中发现, lncRNA MALAT1在高氧肺损伤的小鼠肺组织中表达明显上调[差异倍数(fold change,FC) =2.33,P=0.001].(2)WI38细胞 MALAT1敲除后,MALAT1表达大幅下调(FC = -15.6,P =0.000),CDC6 (FC= -2.37,P =0.001)及 CCNB1(FC = -2.16,P =0.002)均表达下调,DEDD2表达上调(FC =2.46,P=0.000).(3)早产儿外周血标本验证结果表明,与对照组早产儿(0.2734 ± 0.0673)比较, MALAT1在高氧肺损伤早产儿的外周血中表达显著上调(0.3755 ± 0.0819,t =4.634,P =0.015).结论 lncRNA MALAT1可能通过抑制细胞凋亡,对早产儿高氧肺损伤起保护作用,为临床防治早产儿高氧肺损伤提供新策略.
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关键词
Long noncoding RNA,Neonates,Lung injury,Metastasis associated in lung denocar-cinoma transcript 1,Hyperoxia
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![](https://originalfileserver.aminer.cn/sys/aminer/pubs/mrt_preview.jpeg)
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