2011-2015年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析

Chinese journal of microbiology and immunology(2015)

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摘要
目的 揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点.方法 采用时空抽样方法抽样,测定2011-2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用MEGA5.05、BEAST v1.7.0和BioEdit7.1.3软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析.结果 广东48株H3 N2流感病毒的HA序列核苷酸同源性为96.4%~100.00%,2013-2015年广东H3 N2亚型流感病毒HA基因与南半球疫苗株A/Switzerland/9715293/2013的同源性为97.8% ~98.7%,抗原性较为接近.序列系统进化分析显示,其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸,广东毒株主要分布在3C.3a分支,2015年部分毒株出现在3C.2a分支.2011-2015年HA基因共出现1 16个氨基酸位点突变,其中12个氨基酸位点突变涉及4个抗原表位,N241D(N225D)和K192C突变发生在受体结合部位和其中的190螺旋区内.结论 2011-2015年广东甲型H3N2毒株HA抗原变异明显,抗原变异的积累可能出现抗原漂移和流感暴发,应该加强流感病原学监测,及时发现新的流感变异株,为流感防控和降低流感对公众健康危害提供科学依据.
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