应用基因芯片技术筛选大肠腺瘤-癌序列相关基因的初步研究

目的 筛选贯穿于大肠癌发生、发展全过程的基因,探讨大肠腺瘤-癌序列发生的分子机制.方法 Trizol法分别提取正常大肠黏膜,大肠腺瘤,Dukes A、Dukes B和Dukes C-D大肠腺癌组织的总RNA,分离纯化mRNA,逆转录得双链cDNA,生物素标记cRNA探针,与Affymetrix U133 PLAS2.0基因芯片(涵盖18400个转录本,代表14500个功能已知的基因)杂交,Gene Scanner3000激光系统扫描,GCOS 1.2分析软件读取处理杂交信号.计算机分析,比较5种组织基因表达谱差异.结果 分别以大肠腺瘤,Dukes A、Dukes B和Dukes C-D大肠腺癌组织与正常大肠黏膜组织的基因表达谱相比后发现在4个组中存在共同表达差异的基因253个,其中表达持续上调基因34个(已知基因29个,未知功能基因5个),表达持续下调基因219个(已知基因196个,未知功能基因23个).结论 大肠癌的发生发展是一个多基因参与的复杂演变过程.这些基因在大肠癌前病变-大肠腺瘤阶段就已经有异常表达,说明正常大肠黏膜细胞恶性转变的潜能在癌前病变阶段就已经存在,并且其作用持续贯穿于大肠癌发生发展的整个过程.因此,对这些基因的进一步研究有助于全面了解大肠腺瘤-癌序列的分子机制,并对大肠癌的早期诊断和及时干预治疗具有指导意义.