基于高通量技术的SFTS病毒基因组测序方法的建立

目的 建立一种基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒(svvere fvver with thrombocytopenia syndrome virus,SFTS)基因组的测序方法.方法 提取SFTS病毒核酸,分别采用随机引物和oligo (dT)磁珠特异性抓取核酸的方法,优化扩增和纯化条件并建库,利用二代测序仪检测病毒核酸序列.结果 3株病毒采用两种方法测序结果差距较大,利用随机引物建库法获得的数据测序深度和覆盖度明显低于oligo(dT)磁珠抓取建库法.采用oligo(dT)磁珠抓取建库的方法,可对提取的核酸大于300ng的毒株进行测序,3株病毒测序深度都在900以上,覆盖度均超过99％,与NCBI上数据匹配度在90％以上.结论 利用oligo(dT)磁珠抓取SFTS病毒核酸的方法 进行建库,建立了基于二代测序平台的SFTS病毒基因组检测方法.