珠海市2011-2016年诺如病毒胃肠炎暴发疫情的分子流行病学研究

目的 了解珠海市2011-2016年间导致胃肠炎暴发疫情的诺如病毒病原学特征.方法 收集2011-2016年间珠海市56起诺如病毒感染导致的胃肠炎暴发疫情病例肛拭子标本576份,应用实时荧光定量RT-PCR技术,检测诺如病毒GⅠ群、GⅡ群核酸,在每起疫情中随机选取3～4份诺如病毒阳性标本,应用RT-PCR技术扩增主要衣壳蛋白VP1区基因片段并测序分型,每起疫情选取1株进行种系进化分析.结果 56起胃肠炎疫情中,出现8个基因型,都是G Ⅱ群.G Ⅱ.4/2006b于2011-2012年流行季流行后,被其变异株G Ⅱ.4/Sydney_2012取代,该变异株主导2012-2013流行季,于201 3年2月G Ⅱ.4及其变异株均消失.2014-2015流行季所发生的12起都是G Ⅱ.17;2015_2016流行季共发生7起都是G Ⅱ.3;2016年6月到9月分别是G Ⅱ.17和G Ⅱ.3;2016年11月-12月12起全部是G Ⅱ.p16-G Ⅱ.2.2011-2016年间未发现由G Ⅰ群病毒引发的疫情.结论 引起本地暴发疫情的诺如病毒均为GⅡ群,多个基因型别更替流行.2016年底重组株G Ⅱ.p16-G Ⅱ.2出现并引起多起疫情,提示今后监测中应密切关注该重组诺如病毒的流行和进化.