2013 年青岛地区手足口病病原谱及三种主要肠道病毒青岛分离株的基因特征分析

目的 阐明2013年青岛地区手足口病(HFMD)病原谱及肠道病毒71(EV71)型、柯萨奇病毒A16(CVA16)型和柯萨奇病毒A6(CVA6)型青岛分离株的基因特征. 方法 用荧光RT-PCR法检测2013年青岛地区HFMD患者咽拭子标本中的总肠道病毒( EV)、EV71、CVA16和CVA6,对阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增、基因序列测定及系统进化分析. 结果 2013年共检测841个手足口病轻症病例和107 个重症病例,肠道病毒阳性率64 .3%,主要病原构成为EV71 ( 44 .8%)、CVA6(28.2%)和CVA16(9.5%). CVA6超过CVA16成为手足口病的第二大致病原,占3岁以下儿童肠道病毒构成的42 .7%,占重症病例分离病原的22 .2%,在手足口病病原构成中所占比例随年龄增长呈下降趋势( P<0 .001 ). VP1全长的系统发生分析显示,2013年EV71属于C4基因亚型中的C4a,CVA16属于B1亚型的B1a和B1b,与其他地区同期参考株无明显差别;CVA6的VP1序列分为A~F 6个基因组,青岛地区CVA6分离株分处A和D基因组,2013年CVA6青岛分离株83 .9%位于A基因组,16 .1%位于D基因组;2012年CVA6青岛分离株66 .7%位于A基因组,33 .3%位于D基因组;2008—2011年CVA6青岛分离株全部位于D基因组. 结论 EV71、CVA6和CVA16是2013年青岛地区手足口病的主要病原;CVA6所占病原构成随年龄增长呈下降趋势;EV71 流行亚型为C4a, CVA16流行亚型为B1a和B1b;CVA6优势毒株在2008—2013年间显示出由D基因组向A基因组的改变.