海洋弧菌鉴定方法学评价

近年来，由海洋细菌导致的感染越来越常见，弧菌是海洋细菌中最常见的类群之一，可引起人类腹泻、菌血症及外伤感染，严重时可导致死亡。目前，对海洋弧菌尚缺乏快速可靠的鉴定方法。16S rRNA 序列分析目前被公认为细菌鉴定的金标准。然而由于海洋细菌进化缓慢，且基因具有高同源性，16S rRNA 测序并不能对海洋弧菌进行可靠鉴定。编码 RNA 聚合酶β亚基的基因 rpoB 为序列较长的单拷贝基因，可以克服16S rRNA 的高度保守性。至今为止，许多研究已经证明 rpoB 基因可用于各种细菌的分类，包括芽孢杆菌、军团菌、分枝杆菌、葡萄球菌等［1］。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（ matrix-assisted laser desorption / ionization time-of-flight mass spectrometry，MALDI-TOF/ TOF MS）技术是近年发展起来的一种全新的用于微生物快速鉴定的技术，具有快速、稳定、准确、重复性好的特点。为促进海洋弧菌的快速可靠鉴定，本研究利用16S rRNA 测序、rpoB 测序和MALDI- TOF/ TOF MS 3种技术对128株海洋弧菌同时进行鉴定，对比分析检测结果并进行方法学评估。