多重 RT-PCR 与液相悬浮芯片检测临床腹泻相关病毒的比较
Chinese Journal of Laboratory Medicine(2015)
Abstract
目的:比较实验室建立的多重RT-PCR与液相悬浮芯片对于临床腹泻相关病毒(腺病毒40/41型、诺如病毒GⅠ型和GⅡ型,星状病毒和札如病毒)的检测效能。方法多重RT-PCR方法学建立。收集2013年9月至2014年2月因腹泻至南方医科大学珠江医院就医的患者的粪便标本共107份。利用液相悬浮芯片技术和多重RT-PCR分别检测标本的腺病毒40/41型、诺如病毒GⅠ型和GⅡ型,对液相悬浮芯片未涵盖的星状病毒和札如病毒,以RT-PCR为参考,评估多重RT-PCR方法的特异度、敏感度。采用配对计数资料的Kappa系数检验,比较方法间的吻合度。多重RT-PCR和RT-PCR平行扩增10倍连续稀释的5种病毒质粒,测定多重RT-PCR的检测限。结果建立的多重RT-PCR方法与液相悬浮芯片、RT-PCR的检测一致性高,Kappa值分别为0.885和1.000,P均=0.000。以液相悬浮芯片为标准,多重RT-PCR检测敏感度为80.8%(21/26),特异度100.0%(295/295)。多重RT-PCR对5种病毒的检测限为104~106拷贝/μl。结论多重RT-PCR与液相悬浮芯片对于临床标本检测显示一致性佳,特异度和敏感度高,快速、高通量,适用于临床微生物实验室常见腹泻相关病毒的多重检测。(中华检验医学杂志,2015,38:387-391)
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Key words
Diarrhea,Adenoviridae,Norovirus,Mamastrovirus,Multiplex polymerase chain reaction,Reverse transcriptase polymerase chain reaction
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