福建省首例人感染H5N6禽流感病例实验室诊断与病毒序列初步分析
Chinese Journal of Clinical Hepatology(2018)
Abstract
目的 分析福建省首例人感染H5 N6禽流感病例的实验室检测结果,为今后实验室检测和疫情防控提供依据.方法 采集患者咽拭子和外环境标本,提取病毒RNA,采用Real-time PCR方法检测标本H5N6亚型流感病毒,对病毒HA和NA基因片段采用一步法RT-PCR进行扩增并测序,利用生物信息学软件初步分析病毒进化特征.结果 病例咽拭子标本经实验室确诊为H5N6亚型流感病毒,命名为:A/Fujian-Sanyuan/21099/2017(H5N6);不同时间先后5次采集患者咽拭子标本,前3次仍检出H5N6流感阳性;采集43份外环境标本,检测出16份H5阳性标本;同源性分析发现A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (H5N6)病毒的HA和NA基因分别高度同源于A/Cygnus atratus/Hubei/2Z2-O/2016(H5N8)病毒和A/chicken/Hubei/ZYSJF16/2016(H5N6)病毒,同源性分别达99.6%和99.0%;氨基酸分析发现,病毒HA基因切割位点具有多个连续的碱性氨基酸,氨基酸序列为:PLREKRRKR*GLF.结论 该患者为福建省首例人感染高致病性H5N6禽流感病毒病例,该病毒HA和NA基因分别与H5N8和H5N6病毒基因高度相似.
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Key words
Human infected avian influenza H5N6 virus,Laboratory detection,Hemagglutinin and neuraminidase,Phylogenetic tree
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