广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列变异分析

目的 了解广州市男男性行为HIV-1主要流行株Gp120基因的序列特征.方法 收集广州市男男性行为HIV-1感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录巢式PCR扩增获得HIV-1膜基因Gp120全长,对获得的序列进行系统进化树、长度多态性、V3环氨基酸、辅助受体预测及特征性氨基酸分析.结果 61例样本分为4个亚型,主要流行株为CRF07 BC(34/61,55.74％)和CRF01 AE亚型(24/61,39.34％).主要流行株Gp120序列长度为496～515个氨基酸,V1和V3高变区分别表现出最高和最低的长度多态性.主要流行株V3环顶端四肽的主要形式为GPGQ(56/58,96.55％),4种方法综合预测主要流行株的辅助受体主要为CCR5(50/58,86.21％).广州市男男性行为HIV-1感染者中流行的CRF01 AE亚型毒株存在4个特征性氨基酸,出现频率为0.75～0.83,CRF07 BC亚型毒株存在8个特征性氨基酸,出现频率为0.74～0.94.结论 广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列长度有着较高的多态性,V3环顶端四肽、辅助受体和特征性氨基酸有其自身特点.