应用蛋白质的相互作用网络图筛选鼻咽癌放射抗拒相关基因

目的 应用蛋白质相互作用网络图,寻找鼻咽癌放射抗拒相关的分子标志物,探讨鼻咽癌放射抗拒机制.方法 应用全基因组表达谱芯片,初步筛选出2种不同放射敏感性细胞株CNE-2R与CNE-2的差异表达基因.采用计算机软件随机选取4个差异表达基因,分别设计引物,用半定量RT-PCR技术检测验证.将2次实验中均出现的差异有统计学意义的基因导入SNOW在线数据库进行分析,绘制差异基因相互作用网络图,网络中心节点作为鼻咽癌放射抗拒相关分子标志物；进一步采用Western blot检测关键节点STAT1在CNE-2R与CNE-2表达差异.结果 CNE-2R与CNE-2相比,2次芯片实验中均出现的差异基因374个,其中差异有统计学意义的基因197个；随机选取的4个差异表达基因RT-PCR结果与芯片扫描结果相似,具有相同的方向性.197个共有的差异有统计学意义的基因编码蛋白经SNOW分析存在相互作用,并构成一个复杂的相互作用网络图,寻找到了关键性的节点为STAT1和JUN.Western blot结果显示,STAT1-d在CNE-2R中表达明显高于CNE-2(t =4.96,P＜0.05).结论 关键性的节点STAT1和JUN可能是引起鼻咽癌放射抗拒的分子标志物,STAT1-α可能与鼻咽癌放射抗拒发生密切相关.