甲胎蛋白阴性与甲胎蛋白阳性肝细胞癌基因表达谱差异研究

目的 肝细胞癌是具有不同临床表现和分子生物学特征的异质性疾病,本研究比较甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)阴性和AFP阳性肝癌的mRNA表达谱差异,并进行生物信息学分析.方法 采用安捷伦4 ×44k基因芯片平台,检测合并乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染的20例AFP阴性和20例AFP阳性肝癌组织的mRNA表达谱,用生物信息学方法进行差异基因分析及GO Pathway分析,并用real time PCR验证芯片结果. 结果 通过表达谱芯片分析,在AFP阴性和AFP阳性肝癌组织中发现352个差异表达基因.主成分分析及GO Pathway分析显示,AFP阴性肝癌组织高表达基因62个,主要参与细胞凋亡和程序性死亡等过程,AFP阳性肝癌高表达基因290个,主要参与有丝分裂和细胞周期等过程.real time PCR验证差异基因LAMB3和STARD5的表达,结果与表达谱芯片结果一致.结论 AFP阴性肝癌和AFP阳性肝癌基因表达特征不同,提示不同AFP水平的肝癌的发生和发展存在不同的分子机制.