一株新的溶血葡萄球菌溶原性噬菌体IME-SA4的诱导、全基因组测序和比较基因组分析
Journal of Chinese Physician(2018)
Abstract
目的 从一株医院分离的溶血葡萄球菌SA98中诱导出一株新的溶血葡萄球菌溶原性噬菌体,观察其形态与大小,完成全基因组测序和分析基因组结构和进化关系.方法 利用丝裂霉素C从溶血葡萄球菌SA98中诱导噬菌体,噬菌体经浓缩纯化后采用负染电镜观察其形态和大小,提取该噬菌体的基因核酸并完成全基因组高通量测序,分析噬菌体全基因组的结构特征和进化关系.结果 利用丝裂霉素C从溶血葡萄球菌中成功诱导出噬菌体IME-SA4,电镜观察显示,噬菌体IME-SA4头部呈立体对称,有一长尾;噬菌体IME-SA4基因组全长41 843 bp,比对分析发现IME-SA4只与亲缘关系最近的一株葡萄球菌噬菌体phiRS7有13%的同源性.结论 笔者成功从溶血性葡萄球菌SA98中诱导出一株与其他葡萄球菌噬菌体同源性很低的新的溶原性噬菌体,其形态学研究、全基因组测序和比较基因组分析为进一步研究该类噬菌体特性和实际应用提供了依据.
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Key words
Staphylococcus haemolyticus,Staphylococcus phages,Virus activation,Genome-wide association study
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