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抗生物素蛋白与DNA相互作用的单分子研究?

ACTA PHYSICA SINICA(2016)

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Abstract
抗生物素蛋白(avidin)在生物单分子实验中被广泛用于DNA与修饰表面的连接,同时avidin也可作为一种DNA载体用于基因治疗中.本文利用原子力显微镜(AFM)、动态光散射(DLS)、单分子磁镊(MT)技术系统地研究了avidin与DNA之间的相互作用,以及avidin引起DNA凝聚的机理.首先通过AFM对avidin-DNA复合体形貌进行观察,发现不但有avidin导致DNA凝聚的环状形貌,同时也存在avidin自身聚集引起的DNA凝聚现象,通过定量分析,发现其凝聚尺寸越来越小,而当avidin浓度大于2 ng·μL?1时,其凝聚尺寸又突然变大. DLS实验结果也显示了同样的规律,伴随着avidin浓度的升高, DNA的粒径大小从大约170 nm减小到125 nm左右,其电泳迁移率由?2.76(10?4 cm2·V?1·s?1)变化到?0.1(10?4 cm2·V?1·s?1).此外,通过MT技术的力谱曲线变化,发现avidin导致的DNA凝聚与其他多价离子相比,长度的变化曲线几乎呈线性变化,偶尔存在少而小的阶跃,这种变化趋势与组蛋白的变化曲线更相似.因此可以判断, avidin导致DNA凝聚是由avidin与DNA的静电吸引和avidin自身聚集两种相互作用引起的.
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Key words
DNA condensation,avidin,magnetic tweezers,atomic force microscope
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