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脊尾白虾肠道微生物菌群结构

Microbiology(2015)

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摘要
[目的]研究海水池塘养殖条件下的脊尾白虾肠道微生物菌群组成及多样性.[方法]采用PCR-RFLP技术,以直接提取的脊尾白虾肠道细菌总DNA为模板进行16S rRNA基因扩增,产物与T载体连接建立质粒文库,从RFLP建立的文库中筛选出不同细菌来源的克隆子,将测定的差异克隆子16S rRNA片段序列与GenBank数据库进行比对.[结果]从脊尾白虾肠道的菌群文库中共获得114个克隆子,Hae Ⅲ和MspⅠ双酶切得到11种差异克隆子;对差异克隆子测序后,其中8个差异序列与已知细菌具有较高的同源性,分别是假单胞菌属(Pseudomonas)、肠杆菌属(Enterobater)、冰冻小杆菌属Frigoribacterium)、褐杆菌属(Phaeobacter)、弧菌属(Vibrio)、赤杆菌属(Erythrobacter)、气单胞菌属口eromonas)、葡萄球菌属(Staphylococcus)和其他未培养细菌.[结论]初步揭示了脊尾白虾肠道微生物菌群结构的组成,为开发脊尾白虾专用微生态制剂提供基础资料.
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关键词
Exopalaemon carinicauda Holehuis,Intestine,Microbial community
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