禾本科植物内生真菌研究20:基于NRPS5基因的我国东部早熟禾亚科植物内生真菌系统发育学分析

[背景]冷季型禾草-Epichloae真菌内生共生体在我国广泛存在,Epichloae内生真菌具有遗传多样性.[目的]选取来自江苏、山东和安徽等6省共8地的早熟禾亚科植物中的21个Epichlo(e) sp.菌株,检测菌株的NRPS5基因;分析不同宿主内Epichlo(e)属内生真菌NRPS5基因多样性.[方法]提取Epichlo(e) spp.菌株DNA,利用特异性引物对菌株中NRPS5基因进行PCR检测和序列分析,并基于NRPS5基因构建最大简约法系统发育树.[结果]NRPS5基因可能广泛分布于我国东部冷季型禾本科植物Epichloae内生真菌中.在同种内生真菌和同一宿主(除鹅观草)中的不同种内生真菌中NRPS5基因相对保守,但不同宿主的内生真菌其碱基序列差异大,与宿主植物采集地点、采集时间和子座的有无均无相关性,NRPS5基因的差异主要与宿主植物有关.这说明NRPS5基因序列比较保守,推测属于NRPS蛋白的功能核心区.[结论]NRPS5基因序列相对保守,可作为真菌遗传多样性分析的一种辅助手段.