基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析
Chinese journal of oil crop sciences（2015）
摘要
提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一.本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL.通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列.利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因.其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白.13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息.大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息.
更多关键词
soybean,amino acids,genes,sulfur-containing,meta-qtl
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