Caractérisation du contenu génique de petits chromosomes marqueurs surnuméraires par analyse chromosomique sur puce à ADN chez des patients infertiles

L’observation de petits chromosomes marqueurs surnuméraires (sSMC) sur le caryotype est plus fréquente lors d’une infertilité que dans la population générale (0,125 % vs 0,043 %) [1]. La survenue d’une infertilité peut être due à une perturbation de la méiose [2] mais aussi potentiellement à une amplification de certains gènes. Néanmoins, bien que 30 % des sSMC soient associés à un déséquilibre de l’euchromatine, le contenu génique précis n’est pas toujours caractérisé [3]. Nous avons réalisé depuis 2011 au sein du service de cytogénétique du CHU de Rennes une analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA) pour tous les sSMC identifiés chez des patients masculins et féminins infertiles, afin de mettre en évidence la présence de gènes sur ces sSMC. Sur notre cohorte de patients infertiles, 7 (4 hommes/3 femmes) présentent un sSMC, dont 4 sont en mosaïque. Trois sSMC proviennent des chromosomes 15 ou 13/21 (ACPA normale). Pour 4 sSMC, l’ACPA montre un gain de matériel chromosomique : un der(1) (gain 1p121q12 de 22,5 Mb), un psu idic(14) (gain 14q11.2 d’1 Mb), un r(18) en mosaïque (gain 18p11.31q11.2 de 15,2 Mb) et un idic(22) en mosaïque (tétrasomie 22q11.1q11.21 de 2.5 Mb) caractéristique d’un syndrome Cat Eye de type 1. Ces gains impliquent entre 10 et 76 gènes. Certains d’entre eux sont des gènes candidats pour l’infertilité impliqués dans la division cellulaire ou la gonadogenèse (ex. : ESCO1, CABYR…) ou sont des gènes connus pour être impliqués dans l’infertilité chez un individu de sexe opposé (ex. : TAF4B responsable de défaut de spermatogenèse [4] présent au niveau du sSMC d’un sujet féminin). Des informations additionnelles concernant les gènes impliqués sont nécessaires pour établir un lien clair avec le phénotype (mise en évidence d’une surexpression génique et conséquences attendues dans des études fonctionnelles, confrontation aux données récentes de séquençage d’exome réalisé chez des patients infertiles).