计算机辅助CRISPR向导RNA设计
Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology（2017）
摘要
基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中.计算机辅助的向导RNA (Guide RNA)设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一.目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶.文中对于目前存在的sgRNA设计工具进行综述,并且说明可以通过建立高效的计算模型,对当前的异质基因编辑数据进行整合挖掘,以获得无偏差的sgRNA设计规则,并预测影响sgRNA设计的关键特征.笔者认为,对于sgRNA打靶和脱靶效果的系统总结和评价,将有助于使用CRISPR系统进行更加精准的基因编辑和基因治疗.
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关键词
CRISPR,genome editing,in-silico sgRNA design,off-target
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