浙江及周边地区猪流行性腹泻病毒S基因分子特征分析

对2013年4月至2017年4月间浙江省及周边24个地区共282份病料进行猪流行性腹泻病毒(porcine epidemicdiarrhea virus,PEDV)、轮状病毒A型(porcine group A rotavirus,GARV)、猪δ冠状病毒(porcine detacoronavirus,PDCoV)和猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)等病原的检测,并选取其中的16份PEDV阳性样品进行S基因克隆和序列分析.结果显示:PEDV的检出率为64.89％ (183/282),GARV为0.35％(1/282),PDCoV为4.25％(12/282),而未检出TGEV;PEDV在11月1日至次年4月1日间的累计检出率为74％,其余时间段的累计检出率为26％.对PEDV的S蛋白进行分子演化分析表明,PEDV可分为3个群,其中16份阳性样品均位于Ⅲ群,与疫苗毒株CV777、SM98和DR13株相比,核苷酸同源性为93.6％～95.2％,氨基酸同源性为92.4％～94.9％.16份PEDV阳性样品与中国PEDV的CV777疫苗毒株相比,形成了3个新的N-糖基化位点,破坏了1个N-糖基化位点.综上表明,当前仔猪腹泻主要病原为PEDV变异株,防控猪流行性腹泻需要注意季节的变化,也需要加快流行株疫苗的开发.