Relation entre apports nutritionnels et composition du microbiote dans une cohorte de femmes en bonne santé

Discipline Clinique. Introduction et but de l’etude Le microbiote est considere comme un organe a part entiere dont les desequilibres sont associes a la survenue de pathologies chroniques metaboliques, mais egalement proliferatives. La composition du microbiote est influencee par de nombreux facteurs, notamment alimentaires. Notre objectif est d’evaluer la relation entre les principaux composants alimentaires et la composition du microbiote fecal. Materiel et methodes L’analyse d’enquetes alimentaires sur 3 j, (Nutrilog 3.11) a ete mise en lien avec la composition du microbiote fecal, chez 30 femmes en bonne sante. Les analyses du microbiote ont ete menees par sequencage de la region V3–V4 de l’ADNr 16S (MiSeq, Illumina©). Richesse, diversite microbienne, abondances et % des phyla microbiens sont compares entre le 1er quartile (Q1) et le 4e quartile (Q4) d’apport des principaux macronutriments (test de Wilcoxon, SAS v 9.4) : apport en glucides (simples et complexes), en proteines (vegetales et animales), en lipides (AGS, AGMI, AGPI, Ω3, Ω6, LA, ALA, DHA et EPA) et alcool (resultats exprimes en mediane [Q1 vs Q4]. Resultats et analyse statistique La diversite (indice Shannon) et la richesse microbienne (indice Chao1) ne sont pas impactees par les variations d’apport de macronutriments. L’apport quotidien en alcool est associe a l’abondance bacterienne (Log bact. totales : 11,29[11,24–11,37] vs 11,46[11,39–11,57], p = 0,0128), et l’apport en proteines animales a des differences d’abondance relative en Bacteroidetes (p = 0,032). Les abondances relatives des principaux phyla sont significativement differents selon l’apport lipidique total, avec notamment une abondance relative plus importante en Firmicutes (58,54 % [52,44–60,60] vs 51,27 % [45,51–54,49], p = 0,04) et plus faible en Bacteroidetes (33,69 % [29,48–36,39] vs 41,89 % [34,26–45,11], p = 0,04) pour les forts consommateurs. Un apport accru en acides gras satures est associe de facon significative a une diminution de l’abondance relative du phylum Proteobacteria (3,94 % [2,79–4,62] vs 1,79 % [1,28–3,23], p = 0,04) et une diminution du ratio Firmicutes/Bacteroidetes (2,05 [0,94–2,48] vs 0,40 [0,27–0,72], p = 0,009). De la meme facon, les abondances relatives des phyla bacteriens different significativement selon l’apport en AGMI et AGPI, notamment les AGPIΩ6 avec une abondance relative augmentee du phylum Verrucomicrobia associee a un apport accru en LA (0,88 % [0,12–1,38] vs 2,9 % [1,92–4,27], p = 0,003). Les AGPIΩ3,tels que EPA et le DHA, sont associes a une diminution de l’abondance relative de certains phyla en particulier Proteobacteria (p = 0,005 et p = 0,01), respectivement. Conclusion L’analyse de la composition du microbiote fecal en lien avec les apports nutritionnels de femmes en bonne sante met en evidence la relation entre les apports journaliers en alcool, proteines animales et vegetales et l’abondance relative des principaux phyla. L’apport lipidique apparait etroitement lie a la composition de la flore, selon le type d’acides gras considere. Cette etude preliminaire suggere qu’une modulation du microbiote pourrait etre testee a travers des apports nutritionnels, notamment lipidiques, adaptes.