Génomique intégrée des tumeurs bénignes corticosurrénaliennes

La phytopathologie des tumeurs benignes corticosurrenaliennes est mal connue. La genomique permet l’exploration extensive des tumeurs au plan moleculaire. Des analyses d’exomes ont identifie des mutations recurrentes de PRKACA (adenomes cortisoliques), du gene de la beta-catenine CTNNB1 (adenomes non secretants) et d’ARMC5 (hyperplasies macronodulaires). Objectif Analyser le transcriptome, le methylome et les anomalies chromosomiques de ces tumeurs ; lien avec le statut mutationel, le type tumoral et de secretion. Methode Cent quarante et un tumeurs benignes (adenomes cortisoliques, adenomes avec Cushing infraclinique, non secretants, Conn, hyperplasies macronodulaires et micronodulaires, maladies de Cushing) ont ete analysees par transcriptome (Affymetrix U133Plus2), methylome (Illumina HumanMethylation27k), puces SNP (Illumina HumanCore) et sequencage NGS cible. Les analyses bio-informatiques ont ete realisees en R. Resultats Le transcriptome identifie 3 grands sous-groupes : les adenomes cortisoliques – associes aux mutations PRKACA –, les adenomes non secretants et infracliniques – associes aux mutations CTNNB1  –, et un groupe heterogene d’hyperplasies – avec notamment un sous-groupe mute ARMC5 –, de Conn et maladies de Cushing. Des signatures specifiques de chaque groupe sont generees. Le methylome retrouve une classification concordante et contribue donc probablement aux profils d’expression genique specifiques de ces sous-groupes. Les anomalies chromosomiques sont peu nombreuses. On retient essentiellement des pertes en 17q et des gains en 9p. Conclusion Les differentes approches de genomique s’articulent en une classification originale concordante des tumeurs benignes de la corticosurrenale. La voie de l’AMPc/PKA pour les adenomes secretants, et la voie Wnt/beta-catenine pour les adenomes non ou peu secretants semblent les principaux activateurs de cette pathologie.