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牦牛和普通牛 DRB1* Intron 1-exon 2序列变异分析

wf(2016)

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摘要
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测 DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP 方法检测 BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处 SNPs 及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处 SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种 intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A 1、A-B 1、B-A 1和 B-B 1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛 DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛 BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛 BoLA-DRB1的遗传标记。
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关键词
Intron 1,Yak,Cattle,Polymorphism,Exon 2,DRB1 gene
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