辽宁省2007～2012年流行风疹病毒基因特征分析

为了解辽宁省2007～2012年流行性风疹病毒基因特征,本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2007～2012年风疹暴发和散发患者的咽拭子标本中分离到145株风疹病毒(Rubella,RV),应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增RV分离株E1基因的945个核苷酸片段,对扩增产物进行序列测定和分析.将辽宁省145株RV与世界卫生组织(WHO)RV 13个基因型的32株参考株基于739个核苷酸片段的基因定型序列构建基因亲缘性关系树.结果提示,辽宁省2007～2012年145株RV分离株均属于1E基因型,核苷酸和氨基酸同源性为97.2％～100.0％和97.6％～100.0％.与2株WHO 1E基因型参考株(Rvi/Dezhou.CHN/02,RVi/ MYS/01)序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6％～99.2％和98.2％～100.0％.除RVi/Shenyang.Liaoning.CHN/13.11/13株病毒在E1基因的第246位发生了突变(Val246-Ala246);RVi/Shenyang.Liaoning.CHN/13.11/4和RVi/Liaoyang.Liaoning.CHN/26.11/2株病毒在E1基因的第262发生相同突变(Asp262-Asn262)外,其他毒株在N-型糖基化位、血凝抑制位点和中和位点等重要抗原位点均未发生变化,抗原性稳定.辽宁省所有1E基因型风疹病毒在E1蛋白的第338位氨基酸发生相同突变(Leu338-Phe338).本研究证实1E基因型为辽宁省RV的优势基因型,近6年来辽宁省风疹疫情是由1E基因型RV的多个传播链引起.