广西莪术DNA条形码通用序列的筛选

目的:莪术类品种繁多,形态相似,不易鉴别,利用DNA barcoding技术评价目前几个热点的DNA通用序列对广西莪术鉴别的能力.方法:本研究使用ITS、ITS2、rpoB、rpoC1、matk、psbA-trnH序列的通用引物对广西莪术进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、种内和种间的变异、barcoding gap,并采取相似性探索BLAST 1方法评价不同序列的鉴别能力.结果:ITS2序列在所研究的广西莪术中的扩增效率为100％,其种内种间变异、barcoding gap与其他DNA条形码候选序列相比具有明显的优势,ITS2序列在广西莪术中的鉴定成功率达到100％,marK、rpoC1和rpoB虽然测序和鉴定成功率都在90％以上,但是其种内及种间差异不明显,ITS虽然barcodinggap明显,但种内和种间遗传变异重叠比例较大,且测序成功率及鉴定效率不理想,psbA-trnH虽然在扩增及测序方面不如ITS2,但是其鉴定成功率为100％,有明显的种内及种间差异.结论:ITS2与psbA-trnH序列能够准确鉴定广西莪术植物,ITS2可以作为广西莪术药用植物的候选DNA条形码序列,而psbA-trnH可作为ITS2的补充序列.