金华猪回肠、结肠古菌结构及其与体脂沉积的相关性研究

本实验旨在研究不同瘦肉率金华猪回肠和结肠古菌菌群结构的差异,分析其与宿主体脂沉积的相关性.选取 35 头 270 日龄金华猪,测定其背膘厚和瘦肉率,从中选择出 8 头脂肪率最高(高脂组,H组)和 8头脂肪率最低(低脂组,L组)的猪,通过 16S rRNA 基因测序方法对其回肠和结肠的古菌结构进行分析.结果表明:广古菌门(Euryarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)为回肠和结肠优势菌门;回肠优势菌属为Euryarchaeota_norank、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)和甲烷粒菌属(Methanocorpusculum),结肠优势菌属为甲烷短杆菌属、Euryarchaeota_norank和热原体属(Thermoplasma);对不同瘦肉率猪的古菌进行对比分析发现,H组的菌群多样性高于L组,且不同瘦肉率猪的古菌结构差异显著,主要体现在Nitrosopumilales_norank、Candidatus Methanomethylophilus、除硫球菌属(Desulfurococcus)、甲烷微球菌属(Methanimicrococcus)和盐红菌属(Halorubrum)等菌属上;进一步开展相关性分析发现,这些菌属的相对丰度与背膘厚存在正相关、与瘦肉率存在负相关;上述结果提示,不同瘦肉率的金华猪肠道古菌结构差异显著,差异菌属与瘦肉率和背膘厚的相关性进一步反映了猪肠道古菌可能影响其脂肪沉淀.