普通烟草DHQ-SDH基因家族分析

为明确DHQ-SDH基因在普通烟草中的功能,用拟南芥DHQ-SDH基因检索烟草基因组数据库,获得普通烟草DHQ-SDHs基因.利用生物信息学分析了NtDHQ-SDHs的基因结构、蛋白质特征、启动子顺式作用元件和基因进化,用qPCR检测了NtDHQ-SDHs的组织特异性表达.结果表明:普通烟草中有8个DHQ-SDHs基因.NtDHQ-SDHs的编码序列在1 248～1 608 bp之间,编码415～535个氨基酸,蛋白质分子量为45.13～58.22 kD,均为稳定蛋白.NtDHQ-SDHs的外显子和内含子数量相对保守,均含有8～10个外显子和7～9个内含子.基序组成和进化分析发现,8个NtDHQ-SDHs被分为2个亚家族,分别来源于普通烟草的两个祖先种(林烟草和绒毛状烟草).NtDHQ-SDHs在普通烟草根、茎、叶和顶芽中都有表达.