烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因家族的全基因组鉴定

为了揭示烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶（Geranylgeranyl pyrophosphate synthase， GGPPS）基因家族的特征和功能，利用生物信息学方法对烟草GGPPS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。在普通烟草中共鉴定出9个成员（大亚基7个、小亚基2个），林烟草、绒毛状烟草中分别鉴定出5个成员（大亚基4个、小亚基1个）。GGPPS的开放阅读框长度为999~1119 bp，编码332~372个氨基酸，蛋白质分子量为36.2~40.7 kD，等电点为5.41~8.32。大亚基和小亚基基因分别含有1个和2个外显子；大亚基与小亚基均具有DD（XX）1-2D和CXXXC保守性基序，但存在一定的差异。在进化过程中，烟草GGPPS家族可能发生了串联重复复制和片断复制；普通烟草GGPPS家族可能发生了基因丢失，NtabGGPPS1-1和NtabGGPPS1-2较其他成员进化速率快，同时可能受到了净化选择。