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鱼腥草乙酰辅酶A酰基转移酶基因克隆、表达及生物信息学分析

Chinese traditional and herbal drugs(2015)

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摘要
目的 通过克隆鱼腥草乙酰辅酶A酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)基因cDNA全长,并展开生物信息学分析和表达分析,为解析鱼腥草萜类次生代谢产物的生物合成机制奠定基础.方法 采用RT-PCR方法获得AACT基因cDNA序列并进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR方法检测了AACT基因在鱼腥草的地下茎、地上茎、叶、花中的表达情况.结果 克隆获得的AACT基因cDNA全长为1 218 bp,编码405个氨基酸.生物信息学预测AACT蛋白不含跨膜区,不含信号肽.AACT基因在鱼腥草地上茎中的表达量最高,达到1.49,其次是地下茎0.96,花和叶中的表达量相对较低,分别为0.20和0.10.结论 首次从鱼腥草中克隆了AACT基因,为进一步阐明该基因在鱼腥草萜类化合物代谢途径中的重要作用奠定基础.
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关键词
Houttuynia cordata Thunb.,acetyl-CoA C-acetyltransferase,RT-PCR,cDNA sequence,differential expression
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