猪博卡病毒NP1基因的克隆及其生物信息学分析

根据GenBank发表的猪博卡病毒主要抗原基因NP1基因设计1对引物，采用降落PCR方法进行扩增，克隆后测序，并对该基因进行生物信息学分析。结果表明：成功克隆到猪博卡病毒NP1基因；NP1蛋白的二级结构中自由卷曲含量最高(51.77%)，无跨膜蛋白，含有1个糖基化位点、30个磷酸化位点，有6个线性B细胞优势抗原表位，分别位于NP1蛋白的7—14位、27—50位、59—73位、85—94位、102—108位、151—155位。