2株猪圆环病毒2型的分离鉴定及全基因组序列分析
Journal of Northwest A & F University(2013)
Abstract
[目的]对河南部分地区疑似猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)感染猪进行病毒分离鉴定,并对分离株的全基因组序列进行分析.[方法]对郑州、焦作两地疑似PCV2感染的猪淋巴结、脾脏和肺脏组织进行PCR检测,对检测为阳性的病料进行PCV2的分离,利用间接免疫荧光试验和PCR扩增进行初步鉴定.用PCR扩增PCV2全基因,经克隆、测序后,用MEGA5.1软件对克隆的序列与GenBank上获取的其他PCV2全基因组进行序列比对.[结果]分离到2株病毒,分别命名为ZHENGZ-12株和JIAOZ-12株.间接免疫荧光试验结果显示,感染病毒的细胞出现了特异的亮绿色荧光.2个分离株全基因组长度均为1 767 bp,与国内外PCV2参考毒株核苷酸序列同源性为92.6%~99.9%,2个毒株之间的核苷酸序列同源性为96.0%,与PCV1核苷酸序列同源性分别为74.6%和77.7%.系统进化树分析结果显示,2个PCV2分离株同国内外分离株的亲缘关系很近;PCV2核苷酸序列比较稳定,其进化不存在明显的地域相关性.[结论]初步证实分离病毒为PCV2,ZHENGZ-12株基因型为PCV-2a,JIAOZ-12株基因型为PCV-2b.
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Key words
circovirus isolation,genome,porcine circovirus type 2,sequence analysis
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